船舶管理中心前身为远洋渔业资源调查船建设管理办公室,负责远洋渔业资源调查船的设计与建造工作。2017年5月,更名为船舶管理中心,负责“淞航”号远洋渔业资源调查船的运行与管理,同时还负责“海鹰”号测量实习船的管理。
按照“1+4+5+25”配置,中心主任1名,全面负责船舶管理中心工作;综合办公室5人,办公室主任1人,1名综合行政人员,劳务派遣海务、机务各1人,负责岸基保障工作;科考实验部5人,实验主管1人,人事派遣实验员4人,负责“淞航”号综合调查实验室工作;“淞航”号25人,事业编制船长1人、轮机长1人、电机员1人,劳务派遣船员22人,负责“淞航”号的运行工作。